Лаборатория подводного вулканизма создана Распоряжением Президиума СО АН СССР об организации Института вулканологии в 1962 г. Лаборатория была создана в 1967 г. и первым зав. лабораторией был д.г.-м.н. К.К. Зеленов. С 1971 г. лабораторию возглавляет д.г.-м.н. Г.П. Авдейко. В 1970-х годах началось проектирование, а затем строительство НИС «Вулканолог» - специализированного научно-исследовательского судна для изучения подводных вулканов.
Проектирование судна было выполнено в СКБ «Ленинская кузница» (г. Киев), а строительство на Хабаровском заводе им. С.М. Кирова. 26 апреля 1976 г. судно было спущено на воду, а 30 ноября, после достройки во Владивостоке, вступило в строй действующих судов АН СССР, и Институт вулканологии стал судовладельцем. Проектирование научных лабораторий судна, оснащение их приборами и оборудованием проходило под непосредственным руководством Г.П. Авдейко, активное участие в его строительстве принимали сотрудники лаборатории Н.И. Селиверстов, В.А. Сологуб, В.А. Рашидов Г.П. Пономарев, А.А. Палуева, Е.В. Попов и др. Судно получило высокую оценку специалистов, и коллектив разработчиков был удостоен премии Совета Министров СССР.
В 1-й рейс судно вышло 7 февраля 1977 г. В период с 1977 по 1991 гг. на судне был выполнен 41 рейс. В 39 экспедициях, проведенных камчатскими учеными, были изучены подводные вулканы и вулканические массивы в Южно-Китайском, Новогвинейском и Беринговом окраинных морях, а также в Соломоновой, Марианской, Идзу-Бонинской, Кермадек, Алеутской и Курильской островных дугах. Многочисленные исследования были выполнены и на восточном, и на западном побережьях Камчатки, у побережья Новой Зеландии, в Филиппинском море и в других районах Тихого океана. Последний рейс НИС «Вулканолог» был проведен в 1991 г. С тех пор судно находится во Владивостоке и стоит, в основном, у причала ДВО РАН. Но за время проведения рейсов получен громадный материал, обработка которого продолжается и в настоящее время.
В 1991-2004 гг. лаборатория находилась в составе Института вулканической геологии и геохимии ДВО РАН. Анализ и интерпретация материалов изучения подводных вулканов проводилась, в основном, в составе этого института.

• выявлены критерии поиска подводных вулканов геофизическими, геологическими и газогидрохимическими методами;
• впервые в мировой практике составлены каталог и база данных по 98 подводным вулканам Курильской островной дуги (ОД);
• выявлены закономерности пространственно-структурной локализации вулканов Курило-Камчатской ОД системы;
• установлены закономерности латеральной (петрогеохимической, минералогической, изотопной) зональности, причины ее возникновения и возможные причины нарушения;